はじめにお読みください
Windows 系なら商用ソフトウェアがお勧めです。ソフトウェアの選択肢が豊富ですし実績をつんだソフトウェアが多いですしね。
Linux 系なら商用ソフトウェアの Disk Director Suite は如何でしょうか。Disk Director Suite のブートディスクのベースは Linux ですし、Ext2/3/ReiserFS と扱えるパーティションも豊富です。